Publications by Denny S. Fernandez del Viso
Demografía
Demografía de Guarea guidonia en el Bosque UPRH Metadata La metadata se encuentra en el la hoja de cálculo: LabEcoPob demografia Guarea bosque UPRH Datos Luego de procesar los datos de campo que se encuentran en la hoja de cálculo anterior, obtuvimos los datos que se encuentran en la pestaña densidadR. library(googlesheets4) densidad <- rea...
898 sym R (1800 sym/8 pcs) 5 img
Modelos Mecanicistas
Modelos Empíricos y Mecanicistas Los modelos estadísticos (empíricos) suelen estar basados en regresiones. Ellos proporcionar un resumen cuantitativo de las relaciones observadas entre un conjunto de variables medidas. Un modelo mecanicista (determinístico) comienza con una descripción de cómo la naturaleza podría funcionar, y procede de...
4173 sym R (3104 sym/12 pcs) 4 img
Regresión Múltiple
Versión 2020 con teoría: Regresión Lineal Múltiple Datos Usaremos los datos bmi en el archivo reg-lin-mul-BMI.csv. Estos son datos de individuos adultos entre 21 y 79 años, con las siguientes variables: BMI, índice de masa corporal (\(kg/m^{2}\)); Age, edad (años); Cholesterol, niveles de colesterol en sangre, (\(mg/dL\)); Glucose, nivele...
2775 sym R (7967 sym/65 pcs) 11 img 4 tbl
Modelos No-lineales
Modelos No-Lineales Tomado de: Mady, R., Rutkowski, D., 2018. What does linear mean? Working with Polynomials and Non-linear Models [WWW Document]. Entom 4940: Advanced Statistical Methods in Ecology. URL https://heather-grab.github.io/Entom-4940/non-linear_w_poly.html#what_model_do_i_use (accessed 8.15.21). Si luego de realizar el ajuste de mu...
3236 sym R (1884 sym/8 pcs) 2 img
Regresión Lineal Simple: transformaciones
Transformaciones y Regresión Polinomial Metadata y examen inicial de los datos Vamos a examinar datos de mediciones de longitud de mandíbulas de venado cuya edad se conoce. Aunque estamos interesados en tener una posible curva de calibración, para muestras con edad desconocida, nos interesa tener un modelo de regresión que podamos comparar c...
2158 sym R (5106 sym/26 pcs) 10 img
Variación Poblacional
Introducción Preguntas e hipótesis Análisis de los datos activación de paquetes una vez que están instalados deben activarse los paquetes con la función library en R: library(readxl) # para leer desde Excel library(ggplot2) library(dplyr) library(multcomp) # para Tukey library(EnvStats) Cargar datos al sistema semillas <- read.csv("data...
1635 sym R (6254 sym/37 pcs) 9 img
MeCoBi - Fibonacci
Resultado de secuencia de reproducción con reglas Con el ejercicio de los roedores descubrimos que podemos usar una función recursiva para obtener los elementos de la secuencia de la reproducción de los roedores. La función básica utilizada es: \[F_n = F_{n-1} + F_{n-2} \tag{1}\] Aplicación de la función recursiva Los procedimientos sigui...
1921 sym R (1287 sym/8 pcs) 4 img
Crecimiento Bacteriano
Parámetros de modelos de crecimiento poblacional Función Gompertz \[y = ae^{-bc^x}\] Crecimiento Logístico \[N_t = \frac{K}{1 + (\frac{K - N_0}{N_0})e^{-rt}}\] Ambas son no-lineales, y algo difíciles para encontrar unos valores iniciales de los parámetros. Datos library(readxl) data <- read_excel("data/ComBaseExport20.xlsx", sheet = ...
1300 sym R (1823 sym/19 pcs) 3 img
SIR modelo mecanicista
Modelos Epidemiológicos Mecanicistas En esta parte del curso vamos a trabajar con modelos construidos a partir del conocimiento de las relaciones entre los elementos que componen un sistema biológico-epidemiológico. El modelo básico que vamos a estudiar se conoce como SIR y se construye mediante la formulación de ecuaciones diferenciales (OD...
8152 sym R (3460 sym/15 pcs) 7 img
Red Trófica
Laboratorio de Análisis de Red Trófica En este laboratorio estaremos analizando los datos de sus observaciones de una red trófica, utilizando el paquete foodweb. Este nos permite calcular algunos índices que describen la red trófica y visualizar la misma. Construcción de la matriz de interacciones Usando una hoja de cálculo crear una tabl...
2318 sym R (43810 sym/7 pcs) 1 tbl