Publications by Diego J. Lizcano, Alejandra Bonilla
insect_Nmix
#Libraries used (Packages) library(ggplot2) # Used for data visualisation (i.e barcharts) library(reshape2) # Manipulation of data frame library(RColorBrewer) # Colours in bar charts library(knitr) # Complies this dynamic report library (readxl) # read excel data library (tidyverse) # Data handling library (plyr) library (hrbrthemes) # ...
536 sym R (15185 sym/38 pcs) 11 img
Bayesian negative binomial
Introduction This document gives an introduction to the statistical analysis of insect data gathered in exclosure experiments. #Libraries used (Packages) library(ggplot2) # Used for data visualisation (i.e barcharts) library(reshape2) # Manipulation of data frame library(RColorBrewer) # Colours in bar charts library(knitr) # Complies this dyn...
984 sym R (7850 sym/23 pcs) 16 img
Pacoche Occu
R Markdown This is an R Markdown document. Markdown is a simple formatting syntax for authoring HTML, PDF, and MS Word documents. For more details on using R Markdown see http://rmarkdown.rstudio.com. When you click the Knit button a document will be generated that includes both content as well as the output of any embedded R code chunks within t...
2718 sym R (7900 sym/51 pcs) 11 img
Document
Modelo de Ocupación Diámico con datos simulados Primero generamos un conjunto de datos simple y simulado con valores específicos de año específicos para los parámetros, así como especificaciones de diseño, es decir, número de sitios, años y encuestas por año. Luego, veremos cómo ajustar un modelo de ocupación dinámico con dependenci...
6407 sym R (9184 sym/30 pcs) 5 img
Modelo de Ocupación Dinámico
Modelo de Ocupacion Dinamico Modelo de Ocupación Dinámico Diego J. Lizcano Este documento contiene un ejemplo del modelo de ocupación de una sola especie y varias temporadas. Este modelo fue descrito por MacKenzie et. al (2003) en: MacKenzie, D. I., J. D. Nichols, J. E. Hines, M. G. Knutson, and A. B. Franklin. 2003. Estimating site occupan...
3652 sym R (104 sym/2 pcs) 4 img 1 tbl
GLMs Fases Búsqueda y Terminal Cubarral
Load Data bat_pas<- read_excel("D:/BoxFiles/Box Sync/CodigoR/Murcielagos/data/Conteos_fases_xFabian.xls") bat_pas_2 <- read_excel("D:/BoxFiles/Box Sync/CodigoR/Murcielagos/data/Conteos_fases_xFabian.xls", sheet = "Sheet2") bat_pas_3 <- read_excel("D:/BoxFiles/Box Sync/CodigoR/Murcielagos/data/Conteos_fases_xFabian.xls", sheet = "S...
3441 sym R (17605 sym/88 pcs) 30 img
Cámaras PVS - WCS Llanos
PROYECTO VIDA SILVESTRE – PVS El Proyecto Vida Silvestre (PVS) es una iniciativa liderada por Ecopetrol S.A., Wildlife Conservation Society (WCS) Colombia y Fundación Mario Santo Domingo, cuya primera fase fue ejecutada junto con diez organizaciones nacionales entre el 2014 y el 2017. El objetivo principal del proyecto es implementar programas...
43546 sym R (48840 sym/81 pcs) 44 img
PVA Lowland Tapir Orinoquia
PVA for Tapir in WCS Orinoquia landscape Perform population viability analysis (PVA) in R Principio de crecimiento poblacional y riesgo de extincion de: Dennis, B., Munholland, P. L. and Scott, J. M. (1991) Estimation of growth and extinction parameters for endangered species. Ecological Monographs 61, 115–143. Base line data from: Ferregu...
1454 sym R (174295 sym/21 pcs) 17 img 1 tbl
PVA Lowland Tapir Orinoquia, spatially explicit version 2
Load packages library(raster) library(viridisLite) library(future) library(foreach) library(xtable) library(sf) library(tmap) library(tmaptools) library(tidyverse) library(popbio) # library(velox) library(steps) library(gridExtra) library(rasterVis) ############################### # resolve namespace conflicts ###################...
14975 sym R (35436 sym/66 pcs) 37 img
PVA Lowland Tapir Orinoquia, spatially explicit version
Load packages library(raster) ## Loading required package: sp library(viridisLite) library(future) ## ## Attaching package: 'future' ## The following object is masked from 'package:raster': ## ## values library(foreach) library(xtable) library(sf) ## Linking to GEOS 3.8.0, GDAL 3.0.4, PROJ 6.3.1 library(tmap) library(tmaptools) libr...
12858 sym R (22527 sym/67 pcs) 20 img