Publications by Ngoc Nguyen
Bài 1: Giới thiệu R và RStudio
I. GIỚI THIỆU R 1.1 Tổng quan về R R là gì? - R là một môi trường thống kê và ngôn ngữ lập trình toàn diện để phân tích và trực quan dữ liệu một cách khoa học và chuyên nghiệp. - R là sự kết hợp giữa ngôn ngữ lập trình và các gói lệnh thống kê -R có nguồn gốc từ ng�...
3773 sym 9 img
Bài thực hành số 7
Cài đặt PACKAGES – “taxize”, “rentrez”, “seqinr” “ape” 1. Truy xuất trình tự DNA từ Genbank Dowload trình tự nucleotide từ các cơ sở dữ liệu online Gọi packages “rentrez” của NCBI library(rentrez) Download trình tự sea <- entrez_search(db="nuccore", term="Lithocarpus vuquangensis [Organism] A...
5468 sym R (15819 sym/107 pcs) 17 img
Bài thực hành số 5
Trực quan hoá dữ liệu bằng biểu đồ với ggplot2 Cài packages “ggplot2” Gọi các packages: library(readr) library(knitr) – Load và view dữ liệu (Lưu ý: Nếu dùng dữ liệu trên mày thì dùng các lệnh khác để đọc dữ liệu hoặc thay thế đường dẫn đến folder lưu dữ liệu của bạn)...
1388 sym R (6436 sym/41 pcs) 10 img
Thực hành Bioinformatic trong R
THỰC HÀNH BIOINFORMATIC TRONG R Cài đặt PACKAGES install.packages(“taxize”, “rentrez”, “seqinr”) BÀI 4: LÀM VIỆC VỚI LOÀI Gọi packages taxize library(taxize) Trích xuất thông tin loài “Helinthus annus ssp. jigeri” gnr_resolve("Helinthus annus ssp. jigeri", data_source_ids=3) ## # A tibble: 1 x 5 ## user_su...
2288 sym R (9247 sym/66 pcs) 5 img
Practicw_No_6
Xây dựng bản đồ phân bố theo tỉnh Chuẩn bị dữ liệu địa lý Download dữ liệu địa lý định dạng .shp của Việt Nam tại website: https://www.gadm.org/download_country_v3.html chọn Shapefile và lưu vể folder trên máy tính. Trong folder VNM_adm load về có 4 mức độ: gadm36_VNM_0.shp là dữ li...
3201 sym R (3360 sym/32 pcs) 6 img
Document
library(ggplot2) library(viridis) ## Loading required package: viridisLite library(highcharter) ## Registered S3 method overwritten by 'quantmod': ## method from ## as.zoo.data.frame zoo ## Highcharts (www.highcharts.com) is a Highsoft software product which is ## not free for commercial and Governmental use cols <- viridis(13) dat...
9 sym R (2509 sym/12 pcs) 2 img
DA_CSK44
Câu 2: Vẽ biểu đồ hộp và biểu diễn giá trị nhỏ nhất library(readr) library(ggplot2) library(tidyverse) ## ── Attaching packages ─────────────────────────────────────── tidyverse 1.3.1 ── ## ✓ tibble 3.1.6 ✓ dplyr 1.0.7 ## ✓ tid...
966 sym R (6136 sym/39 pcs) 7 img
ggstatsplot
Gọi các packages library(readr) library(ggstatsplot) ## You can cite this package as: ## Patil, I. (2021). Visualizations with statistical details: The 'ggstatsplot' approach. ## Journal of Open Source Software, 6(61), 3167, doi:10.21105/joss.03167 Đọc dữ liệu vào R bid <- "https://raw.githubusercontent.com/ngocdlu/data_anal...
1060 sym R (1675 sym/15 pcs) 6 img
Correlation matrix
Correlation Matrix là gì? Correlation matrix: Được dùng để đánh giá mối tương quan giữa nhiều biến cùng một lúc Sử dụng các phương pháp: Pearson, Kendall, và Spearman để tính ma trận tương quan Import dữ liệu vào R library(readr) bid <- "https://raw.githubusercontent.com/ngocdlu/data_analysis/mai...
2786 sym R (6091 sym/47 pcs) 6 img
PCA
Principal Components Analysis (PCA) - Phân tích thành phần chính: Là phương pháp phân tích nhằm giảm chiều dữ liệu (giữ lại những thành phần/biến quan trọng) mà vẫn dữ được các đặc trưng cơ bản của dữ liệu. - Phân tích PCA sẽ giúp chúng ta: Giảm chiều dữ liệu (loại bỏ b...
4665 sym R (28622 sym/43 pcs) 15 img