Publications by Catalina Riquelme
1) Base model
Fenotipo: SM300-Efficiency Modelo: Random Forest Significancia: No Datos: 54 SNP’s Finalidad: contruir un modelo base con el total de SNP’s (54) Preprocesamiento de datos Librerias library(readxl) library(randomForest) library(caret) library(dplyr) Lectura de los datos fenotipo <- "SM300_Efficiency" fenotipos_path <- "C:/Users/ca_re/OneD...
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2) Gen model
Fenotipo: SM300-Efficiency Modelo: Random Forest Significancia: No Datos: 54 SNP’s Finalidad: Realiza un modelo por cada gen (54 en total) Preprocesamiento de datos Librerias library(readxl) library(randomForest) library(caret) library(dplyr) Lectura de los datos fenotipo <- "SM300_Efficiency" fenotipos_path <- "C:/Users/ca_re/OneDrive/Des...
2085 sym
3) Top model
Fenotipo: SM300-Efficiency Modelo: Random Forest Significancia: No Datos: 20 SNP’s (Más importantes) Finalidad: Arma progresivamente modelos, agregando genes con mayor importancia para el fenotipo (20 más importantes) Preprocesamiento de datos Librerias library(readxl) library(randomForest) library(caret) library(dplyr) library(ggplot2) ...
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Best model Top 20 genes
Fenotipo: SM300-Efficiency Modelo: Random Forest Significancia: No Datos: Arma progresivamente modelos, agregando genes con mayor importancia para el fenotipo Preprocesamiento de datos Librerias library(readxl) library(randomForest) library(caret) library(dplyr) library(ggplot2) Lectura de los datos fenotipo <- "SM300_Efficiency" fenotipos...
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54 models (one for each gene)
Fenotipo: SM300-Efficiency Modelo: Random Forest Significancia: No Datos: Analiza cada gen (54 en total) Preprocesamiento de datos Librerias library(readxl) library(randomForest) library(caret) library(dplyr) Lectura de los datos fenotipo <- "SM300_Efficiency" fenotipos_path <- "C:/Users/ca_re/OneDrive/Desktop/Memoria/Desarrollo/fenotipos.xl...
2051 sym
Base model with 54 SNPs
Fenotipo: SM300-Efficiency Modelo: Random Forest Significancia: No Datos: 54 SNP’s Preprocesamiento de datos Librerias library(readxl) library(randomForest) library(caret) library(dplyr) Lectura de los datos fenotipo <- "SM300_Efficiency" fenotipos_path <- "C:/Users/ca_re/OneDrive/Desktop/Memoria/Desarrollo/fenotipos.xlsx" lectura_datos <...
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